校党委书记顾家山主持学校党委全面工作。负责保密、国家安全、维护稳定、宣传思想文化、意识形态、法治、精神文明建设、统战、校友等工作。分管校党政办公室（校友工作办公室）、党委宣传部（新闻中心）、党委统战部。联系公共卫生学院、临床药理研究所、第一临床医学院（第一附属医院、学生党总支）。临时主持学校行政工作。负责发展规划、审计等工作。分管发展规划处（学位办、高水平大学建设办公室）、审计处。联系基础医学院、第二临床医学院（第二附属医院、学生党总支）、合肥综合性国家科学中心大健康研究院健康大数据与群体医学研究所。
校党委副书记谢瑞瑾负责组织建设与干部队伍建设、机关工作、离退休、教代会。分管党委组织部（党校）、校工会、机关党委（机关工作处）、离退休教职工党委（离退休人员工作处）。联系马克思主义学院、卫生管理学院。
副校长余永强负责附属医院管理、安徽省公共卫生临床中心建设、研究生教育、科研基础条件平台建设等工作。分管医院管理处（党委医院工作部）、第五临床医学院、安徽省公共卫生临床中心（安徽省传染病医院）、研究生学院、科研实验中心、实验动物中心。协管合肥综合性国家科学中心大健康研究院健康大数据与群体医学研究所。临时负责国际合作交流、国际学生教育、资产、资产经营、学校医院等工作。代管国际合作交流处（港澳台事务办公室）、国有资产管理处（实验室与设备管理处）、资产经营公司、环球体育-（中国）官方网站医院。联系生命科学学院、巢湖临床医学院（附属巢湖医院、学生党总支）、附属阜阳医院、临床医学院、口腔医学院（附属口腔医院）、国际教育学院。
副校长肖圣龙负责学生思想政治教育、人民武装、保卫、综合治理、本科生管理与创新创业教育、共青团、新医科中心（新校区）建设等工作。分管学生处（党委学工部、就业指导中心）、创新创业学院、保卫处（武装部、综治办）、校团委（大学生艺术教育中心）、党委研究生工作部、新医科中心（新校区）项目建设指挥部。联系生物医学工程学院、附属小学。
副校长吕雄文负责本科生教育教学、继续教育、招投标、图书、档案、体育等工作。分管教务处（招生办、课程思政中心）、医学高等教育研究所（教师教学能力发展中心、教学质量评估中心）、网络与信息化管理处、图书馆、数据信息中心（档案馆、校史研究所）、招投标管理办公室、实验教学中心、继续教育管理办公室、继续教育学院、体育运动委员会。临时负责出版工作，代管出版中心。联系药学院、人文医学学院、护理学院。
校纪委书记黄新美主持学校纪委工作。分管纪委办公室、校党委巡察工作领导小组办公室。
副校长徐朝阳负责学校人事、后勤、安全生产、卫生，南校区、东校区（建设）管理，常态化疫情防控等工作。分管人事处（党委教师工作部）、后勤管理处（后勤集团）、南校区管理委员会、东校区管理委员会（东校区建设办公室）、爱国卫生运动委员会。临时负责财务、基金会工作。代管财务处。联系法学院、环球体育-（中国）官方网站教育基金会。
学术副校长张智负责科学研究与产业管理、重点实验室建设等工作。分管科技产业处（技术转移服务中心）、安徽省转化医学研究院。协管学科建设提质工作。联系精神卫生与心理科学学院。